Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc7Q9D541 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc7Q9D541 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc7Q9D541 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms