Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrameQ9D4Z5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrameQ9D4Z5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrameQ9D4Z5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms