Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D4W2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D4W2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D4W2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D4W2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D4W2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D4W2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms