Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rabl3Q9D4V7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabl3Q9D4V7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabl3Q9D4V7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms