Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lonrf3Q9D4H7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lonrf3Q9D4H7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lonrf3Q9D4H7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms