Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Odf2lQ9D478 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Odf2lQ9D478 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2lQ9D478 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms