Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Urm1Q9D2P4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Urm1Q9D2P4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms