Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syf2Q9D198 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syf2Q9D198 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syf2Q9D198 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms