Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Susd3Q9D176 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Susd3Q9D176 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Susd3Q9D176 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Susd3Q9D176 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms