Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rfc5Q9D0F6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rfc5Q9D0F6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rfc5Q9D0F6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms