Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab3bQ9CZT8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab3bQ9CZT8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms