Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snf8Q9CZ28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Snf8Q9CZ28 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snf8Q9CZ28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms