Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ssbp1Q9CYR0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp1Q9CYR0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp1Q9CYR0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms