Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrps28Q9CY16 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mrps28Q9CY16 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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