Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PmpcbQ9CXT8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PmpcbQ9CXT8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PmpcbQ9CXT8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms