Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXS4

Cenpv, Centromere protein V, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpvQ9CXS4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CenpvQ9CXS4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenpvQ9CXS4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CenpvQ9CXS4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CenpvQ9CXS4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CenpvQ9CXS4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CenpvQ9CXS4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CenpvQ9CXS4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenpvQ9CXS4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenpvQ9CXS4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenpvQ9CXS4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms