Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nip7Q9CXK8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nip7Q9CXK8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nip7Q9CXK8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nip7Q9CXK8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms