Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm8aQ9CWZ3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm8aQ9CWZ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm8aQ9CWZ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms