Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx10Q9CWT3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snx10Q9CWT3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx10Q9CWT3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms