Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smyd3Q9CWR2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smyd3Q9CWR2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smyd3Q9CWR2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms