Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK3

Cd2bp2, CD2 antigen cytoplasmic tail-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2bp2Q9CWK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd2bp2Q9CWK3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd2bp2Q9CWK3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd2bp2Q9CWK3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd2bp2Q9CWK3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd2bp2Q9CWK3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms