Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Sycp2Q9CUU3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Sycp2Q9CUU3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Sycp2Q9CUU3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Sycp2Q9CUU3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Sycp2Q9CUU3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
Sycp2Q9CUU3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Sycp2Q9CUU3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Sycp2Q9CUU3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Sycp2Q9CUU3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Sycp2Q9CUU3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Sycp2Q9CUU3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms