Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pard3bQ9CSB4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pard3bQ9CSB4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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