Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRG1

Tm7sf3, Transmembrane 7 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm7sf3Q9CRG1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm7sf3Q9CRG1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tm7sf3Q9CRG1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms