Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Msmo1Q9CRA4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msmo1Q9CRA4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms