Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atp5f1Q9CQQ7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp5f1Q9CQQ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp5f1Q9CQQ7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms