Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc2Q9CQP2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc2Q9CQP2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms