Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl35Q9CQL6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl35Q9CQL6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl35Q9CQL6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl35Q9CQL6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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