Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccer1Q9CQL2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccer1Q9CQL2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccer1Q9CQL2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms