Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rdm1Q9CQK3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rdm1Q9CQK3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rdm1Q9CQK3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rdm1Q9CQK3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Rdm1Q9CQK3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rdm1Q9CQK3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms