Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf2Q9CQJ4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf2Q9CQJ4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf2Q9CQJ4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf2Q9CQJ4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms