Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Commd4Q9CQ02 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Commd4Q9CQ02 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms