Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atg3Q9CPX6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atg3Q9CPX6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atg3Q9CPX6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Atg3Q9CPX6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms