Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt23Q99PS0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt23Q99PS0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt23Q99PS0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms