Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim26Q99PN3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim26Q99PN3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim26Q99PN3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms