Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE9

Arl4d, ADP-ribosylation factor-like protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4dQ99PE9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arl4dQ99PE9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arl4dQ99PE9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Arl4dQ99PE9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms