Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Rims1Q99NE5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rims1Q99NE5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rims1Q99NE5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rims1Q99NE5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms