Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ms4a4dQ99N05 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ms4a4dQ99N05 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms