Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pramel1Q99MW3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pramel1Q99MW3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pramel1Q99MW3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms