Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tdrd1Q99MV1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd1Q99MV1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tdrd1Q99MV1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.8 ms