Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CalcbQ99MP3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CalcbQ99MP3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CalcbQ99MP3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms