Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnpo2Q99LG2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo2Q99LG2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo2Q99LG2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms