Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp16Q99LG0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp16Q99LG0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp16Q99LG0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms