Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcf2Q99LE6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf2Q99LE6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms