Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1aQ99L02 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pagr1aQ99L02 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pagr1aQ99L02 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms