Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed9Q99KF1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmed9Q99KF1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms