Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pls3Q99K51 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pls3Q99K51 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pls3Q99K51 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms