Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EpcamQ99JW5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EpcamQ99JW5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms