Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GatbQ99JT1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GatbQ99JT1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GatbQ99JT1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms