Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl22Q99JN2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klhl22Q99JN2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klhl22Q99JN2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms